Pilsner Urquell stammer fra byen Plzeň. Ølets historie går tilbake til Bürger Brauerei, som ble etablert som et borgerbryggeri i Pilsen i 1839, for å brygge øl etter bayersk oppskrift.
Ettersom pilsnerølet raskt ble populært langt utenfor Bøhmen, og også andre bryggerier begynte å lage «pilsnerøl», registrerte Bürger Brauerei i 1898 varemerket Pilsner Urquell, for å understreke at deres øl var den opprinnelige pilsneren.
Siden 1842 har Pilsner Urquell vært den originale pils eller lager. Navnet Pilsner Urquell betyr dessuten Pilsner fra den opprinnelige kilden (urkilden).
